早期预防是减少先天性心脏病发病率的重要手段。母亲在怀孕早期要避免大剂量辐射、宫内感染，这些因素均可能造成胎心畸形。而孕期的被动吸烟、怀孕早期感冒也是导致先天性心脏病的危险因素。
做好产前检查，对于防止先天性心脏病孩子出生至关重要，这样才能做到对疾病患儿的早发现、早干预、适时治疗。对于胎儿心脏超声检查异常的先天性心脏病高危孕妇，要进一步检查确定胎儿先天性心脏病的复杂程度，对于复杂畸形、预期疗效不佳的病例，建议终止妊娠；部分简单急性、预期疗效满意的病例，可建议孩子出生后再治疗。
对于出生后的孩子，如果检查发现有先天性心脏病，那么要做的就是及早诊治。先天性心脏病患儿的最佳治疗时间，因病情不同差别也较大，不能统而概之。一般比较严重的病情需要在新生儿出生3个月或半年左右进行手术，有些可能需要在出生两周之内马上进行手术（如大动脉转位）。及早发现、及早手术对于先天性心脏病患儿的存活和之后的生活质量影响很大，如果错过最佳的手术时机，孩子不容易存活，有些严重的病情甚至还需要进行多次手术。
目前，国内的技术对于先天性心脏病的治疗状况是可防、可治的，为了以后孩子能像正常人一样生活，应该及早明确诊断，不要错失最佳治疗时机。为了提高先天性心脏病的治疗效果，可以采取内科、外科、介入疗法综合的复合治疗方式。
