自然保护区按照功能性差异划分为核心区、缓冲区和实验区三个功能区。
“保护区的划分，既要发挥其动植物保护的主要功能，也要合理兼顾当地经济社会可持续发展。”全国政协常委郭层城在9月8日全国政协双周协商座谈会上，首先解释了自然保护区划分的原则。
不过在实际调研中，他也发现，“受过去技术条件和认识水平的限制，以及保护区生态环境的变化，使得一些保护价值不高的区域被划入保护区。一些保护区在功能区划分时，将村镇、生产生活设施划入了核心区、缓冲区。”这种“历史遗留问题”，不仅给保护管理工作增加了难度，也给地方经济社会发展造成一定影响。
全国政协常委赵雨森也同样关注到：当保护对象的状况、生态环境与空间格局、人类干扰程度发生明显变化、或者为了提升社会效益时，应该调整保护区功能区。“如果功能区划分不合理，政府的补助非常有限，自身资源又利用不好，保护区难以实现健康长久发展。”
顺应现实，适应发展，委员们给出了具体建议：
郭层城建议“摸清家底”，“建议环保部和林业局组织专家，对划分范围不准确或者需要作出调整的国家级自然保护区，进行实地考察，精准勾勒，科学调整，合理划分。”
赵雨森提到“协调统一”。他认为，可在不影响主要保护对象、不破坏生态环境的基础上，合理利用实验区资源，发展旅游、养殖驯化等产业，增加就业机会，扩大经济效益，提升社会效益，有效协调区域社会经济发展与生态资源保护之间的关系。
“当前要科学确定保护区范围，一些功能区要重新划定。”参会的国家林业局局长张建龙也与委员们观点一致。
科学划定与合理调整，有利于充分优化资源配置，也将利于更长远的保护与发展。委员、专家、相关部门负责人言辞恳切，着眼的正是生态保护的未来。
