从安全角度看，一方面大数据分析在公共安全、网络安全领域已有成功应用案例；另一方面对大数据无限制使用又会造成对公民隐私权的侵犯。此外，大数据本身也是一种资产，在应用中，要从技术和管理两个维度出发，从数据生命周期各个环节上规范使用，达到既能发挥大数据积极作用，又不侵害个人隐私和破坏信息安全的目的。
一、政府要做好顶层设计，在利用大数据前明确使用目标，并将这个目标作为贯穿整个大数据分析过程的大纲，而且目标本身应经过相关机构的评估和监管。二、在数据采集阶段，要紧紧围绕目标，制定合理的数据采集范围，数据采集应遵循“够用”原则。多而无用的数据，不但会影响分析效率，还会因为数据采集过于广泛而侵犯个人隐私。三、在数据维护阶段，对承担大数据存储分析任务的部门和机构，要通过管理和技术相结合的手段，保障部门机构的网络安全。四、在数据使用阶段，围绕大数据分析目标，遵循“最小范围使用”原则。对于跨部门、跨领域的数据使用，要有完善的备案和审核流程。对数据使用完成后，要有相应手段保证数据被安全销毁。
关于大数据应用中的安全保障问题，目前最好的解决办法是实现国产化。建议政府相关部门建立一套有效的国产软件安全保障机制，避免软件出现漏洞。政府应鼓励和引导国内安全团队研究开发性能好的国产化软件，同时督促国产软件供应商建立自身漏洞响应和应急处理机制。
